Predicting grain yield using canopy hyperspectral reflectance in wheat breeding data

Montesinos-López, Osval A.; Montesinos-López, Abelardo; Crossa, José; de los Campos, Gustavo; Alvarado, Gregorio; Suchismita, Mondal; Rutkoski, Jessica; González-Pérez, Lorena; Burgueño, Juan

doi:10.1186/s13007-016-0154-2

Plant Methods

Table 3 Average Pearson correlation (APC), quantile 2.5% (LL) and quantile 97.5% (UL) for the testing set between the observed GY and the predicted GY using only the vegetation index as the predictor variable in each of the environments

From: Predicting grain yield using canopy hyperspectral reflectance in wheat breeding data

Method	Time	Melgas			Drought			Irrigated			Red.Irrigated			EarlyHeat
Method	Time	APC	LL	UL	APC	LL	UL	APC	LL	UL	APC	LL	UL	APC	LL	UL
M1	1	0.148	−0.024	0.312	0.065	−0.103	0.302	0.314	0.173	0.450	−0.041	−0.148	0.072	0.440	0.328	0.566
M1	2	0.148	−0.024	0.312	0.127	−0.028	0.284	0.350	0.267	0.476	−0.072	−0.207	0.010	0.535	0.453	0.623
M1	3	0.167	−0.016	0.280	0.297	0.183	0.434	0.407	0.241	0.525	0.151	0.075	0.254	0.553	0.435	0.667
M1	4	0.239	0.043	0.401	0.352	0.242	0.543	0.381	0.189	0.489	0.206	0.089	0.313	0.561	0.434	0.669
M1	5	0.075	−0.054	0.226	0.248	0.143	0.427	0.438	0.194	0.542	0.188	0.027	0.279	0.598	0.497	0.693
M1	6	0.231	0.025	0.407	0.310	0.191	0.460	0.484	0.359	0.577	0.166	−0.013	0.278	0.598	0.470	0.691
M1	7	0.394	0.275	0.475	0.634	0.509	0.762	0.398	0.189	0.507	0.335	0.196	0.465	0.419	0.330	0.524
M1	8	0.137	−0.091	0.297	0.280	0.174	0.464	0.403	0.239	0.497	0.181	−0.017	0.267	0.560	0.438	0.679
M1	9	0.416	0.312	0.491	0.696	0.616	0.814	0.457	0.336	0.542	0.436	0.286	0.610	0.338	0.255	0.431
M1	6789	0.324	0.178	0.439	0.601	0.486	0.740	0.479	0.318	0.574	0.337	0.169	0.481	0.503	0.411	0.612
M1	789	0.349	0.229	0.451	0.643	0.538	0.774	0.463	0.289	0.563	0.378	0.215	0.527	0.457	0.376	0.569
M1	79	0.415	0.301	0.481	0.681	0.584	0.803	0.441	0.272	0.536	0.404	0.266	0.565	0.385	0.310	0.486
M1	89	0.297	0.133	0.416	0.632	0.540	0.776	0.478	0.328	0.571	0.385	0.202	0.537	0.473	0.399	0.585
M2	1	0.084	−0.069	0.246	0.036	−0.116	0.244	0.199	0.015	0.327	0.036	−0.085	0.248	0.405	0.286	0.579
M2	2	0.084	−0.069	0.246	0.099	−0.100	0.280	0.269	0.113	0.412	0.040	−0.207	0.196	0.502	0.404	0.605
M2	3	−0.023	−0.171	0.114	0.277	0.178	0.372	0.326	0.170	0.453	0.152	0.065	0.283	0.528	0.393	0.651
M2	4	0.120	−0.053	0.324	0.375	0.281	0.536	0.296	0.145	0.392	0.261	0.114	0.388	0.550	0.411	0.689
M2	5	0.028	−0.149	0.192	0.319	0.162	0.510	0.399	0.188	0.502	0.263	0.133	0.334	0.575	0.454	0.675
M2	6	0.139	−0.013	0.297	0.428	0.319	0.586	0.455	0.340	0.547	0.330	0.215	0.398	0.564	0.430	0.653
M2	7	0.412	0.316	0.474	0.673	0.592	0.779	0.437	0.275	0.537	0.405	0.288	0.532	0.439	0.377	0.530
M2	8	0.119	−0.064	0.293	0.325	0.220	0.513	0.333	0.198	0.435	0.278	0.099	0.371	0.556	0.420	0.666
M2	9	0.410	0.303	0.492	0.684	0.611	0.788	0.499	0.369	0.587	0.405	0.311	0.559	0.361	0.257	0.445
M2	6789	0.315	0.219	0.424	0.627	0.544	0.753	0.490	0.361	0.570	0.402	0.281	0.498	0.505	0.414	0.604
M2	789	0.368	0.292	0.475	0.659	0.581	0.778	0.486	0.351	0.579	0.412	0.286	0.525	0.475	0.400	0.575
M2	79	0.423	0.317	0.491	0.695	0.622	0.799	0.491	0.372	0.587	0.417	0.308	0.556	0.408	0.329	0.494
M2	89	0.307	0.196	0.443	0.628	0.545	0.757	0.485	0.359	0.576	0.399	0.275	0.512	0.486	0.407	0.589
M3	1	0.146	−0.039	0.309	0.070	−0.079	0.290	0.300	0.158	0.433	0.028	−0.100	0.192	0.384	0.274	0.514
M3	2	0.146	−0.039	0.309	0.139	−0.010	0.308	0.334	0.260	0.461	−0.034	−0.206	0.058	0.445	0.353	0.518
M3	3	0.162	−0.045	0.301	0.321	0.200	0.485	0.362	0.208	0.480	0.162	0.061	0.277	0.437	0.343	0.544
M3	4	0.225	0.065	0.390	0.380	0.269	0.596	0.339	0.167	0.441	0.221	0.077	0.339	0.454	0.355	0.554
M3	5	0.084	−0.112	0.246	0.247	0.119	0.453	0.392	0.183	0.493	0.183	0.008	0.308	0.500	0.428	0.576
M3	6	0.225	0.053	0.380	0.300	0.162	0.463	0.420	0.300	0.509	0.151	−0.034	0.272	0.501	0.429	0.577
M3	7	0.381	0.276	0.474	0.629	0.500	0.765	0.352	0.158	0.447	0.311	0.134	0.476	0.313	0.216	0.440
M3	8	0.138	−0.088	0.326	0.286	0.182	0.511	0.358	0.201	0.446	0.178	−0.012	0.274	0.475	0.384	0.555
M3	9	0.408	0.288	0.479	0.687	0.596	0.805	0.409	0.313	0.482	0.427	0.290	0.631	0.287	0.198	0.394
M3	6789	0.319	0.183	0.428	0.599	0.487	0.738	0.423	0.270	0.496	0.321	0.147	0.495	0.405	0.338	0.504
M3	789	0.342	0.220	0.447	0.637	0.533	0.766	0.412	0.250	0.488	0.365	0.197	0.549	0.366	0.293	0.472
M3	79	0.405	0.290	0.490	0.674	0.572	0.799	0.393	0.244	0.467	0.391	0.253	0.591	0.304	0.222	0.418
M3	89	0.294	0.135	0.423	0.624	0.536	0.766	0.428	0.295	0.497	0.373	0.196	0.555	0.393	0.335	0.483
M4	1	0.149	−0.035	0.340	0.086	−0.055	0.272	0.303	0.175	0.446	−0.014	−0.154	0.082	0.351	0.215	0.467
M4	2	0.149	−0.035	0.340	0.094	−0.059	0.200	0.327	0.219	0.456	0.039	−0.168	0.157	0.437	0.318	0.515
M4	3	0.224	0.094	0.347	0.312	0.170	0.414	0.311	0.110	0.408	0.194	0.048	0.280	0.446	0.328	0.566
M4	4	0.190	0.039	0.330	0.362	0.222	0.576	0.297	0.032	0.430	0.209	0.060	0.322	0.412	0.298	0.502
M4	5	0.051	−0.111	0.183	0.252	0.115	0.467	0.296	0.010	0.472	0.158	−0.005	0.265	0.471	0.387	0.584
M4	6	0.124	−0.076	0.271	0.148	−0.027	0.315	0.372	0.224	0.497	0.021	−0.075	0.211	0.547	0.391	0.675
M4	7	0.069	−0.046	0.187	0.530	0.381	0.669	0.199	−0.048	0.329	0.131	−0.026	0.230	0.356	0.242	0.491
M4	8	0.060	−0.117	0.200	0.324	0.205	0.527	0.292	0.086	0.432	0.143	−0.051	0.264	0.403	0.299	0.520
M4	9	0.080	−0.016	0.185	0.673	0.599	0.788	0.288	0.108	0.381	0.386	0.231	0.490	0.284	0.189	0.383
M4	6789	0.095	−0.065	0.234	0.537	0.412	0.699	0.335	0.129	0.438	0.214	0.021	0.335	0.421	0.322	0.552
M4	789	0.074	−0.056	0.202	0.589	0.476	0.740	0.298	0.073	0.405	0.281	0.108	0.403	0.364	0.260	0.485
M4	79	0.077	−0.031	0.175	0.629	0.517	0.762	0.248	0.028	0.357	0.292	0.149	0.391	0.326	0.225	0.443
M4	89	0.072	−0.085	0.195	0.590	0.502	0.745	0.332	0.133	0.435	0.331	0.127	0.466	0.358	0.264	0.468
M5	1	0.096	−0.019	0.189	0.223	0.132	0.350	0.120	0.046	0.194	0.089	−0.138	0.301	−0.062	−0.217	0.061
M5	2	0.096	−0.019	0.189	0.130	−0.033	0.249	0.086	−0.007	0.182	0.170	0.019	0.361	0.296	0.151	0.392
M5	3	0.232	0.063	0.356	0.118	−0.057	0.225	0.050	−0.131	0.184	0.119	−0.061	0.267	0.368	0.267	0.474
M5	4	0.113	−0.083	0.222	0.085	−0.006	0.181	0.033	−0.101	0.127	0.045	−0.067	0.222	0.315	0.119	0.435
M5	5	0.152	−0.008	0.308	0.018	−0.133	0.131	0.061	−0.062	0.162	0.080	−0.014	0.254	0.422	0.267	0.500
M5	6	0.055	−0.073	0.147	0.174	0.016	0.280	0.249	0.106	0.339	0.191	0.052	0.272	0.402	0.287	0.497
M5	7	0.371	0.260	0.554	0.482	0.346	0.596	0.423	0.371	0.538	0.351	0.197	0.474	0.393	0.300	0.537
M5	8	0.066	−0.103	0.224	−0.052	−0.134	0.024	0.012	−0.079	0.125	0.101	−0.053	0.277	0.432	0.252	0.532
M5	9	0.380	0.267	0.524	0.447	0.254	0.562	0.406	0.340	0.538	0.270	0.124	0.412	0.284	0.113	0.468
M5	6789	0.197	0.098	0.314	0.458	0.278	0.585	0.406	0.339	0.500	0.324	0.168	0.430	0.452	0.366	0.601
M5	789	0.266	0.159	0.407	0.475	0.298	0.602	0.398	0.336	0.520	0.324	0.169	0.443	0.432	0.329	0.590
M5	79	0.384	0.271	0.549	0.495	0.324	0.615	0.425	0.372	0.554	0.322	0.177	0.456	0.353	0.226	0.521
M5	89	0.174	0.051	0.288	0.417	0.215	0.544	0.346	0.269	0.457	0.273	0.133	0.426	0.437	0.320	0.595
M6	1	0.128	−0.064	0.323	0.048	−0.110	0.326	0.273	0.151	0.420	0.027	−0.092	0.177	0.370	0.232	0.521
M6	2	0.128	−0.064	0.323	0.083	−0.082	0.257	0.339	0.254	0.465	−0.036	−0.209	0.058	0.423	0.319	0.509
M6	3	0.123	−0.041	0.222	0.344	0.274	0.472	0.298	0.086	0.426	0.223	0.134	0.315	0.425	0.298	0.522
M6	4	0.206	0.010	0.366	0.392	0.305	0.608	0.255	0.044	0.381	0.287	0.138	0.396	0.437	0.297	0.556
M6	5	0.053	−0.177	0.226	0.302	0.144	0.542	0.304	0.072	0.414	0.259	0.114	0.352	0.508	0.400	0.592
M6	6	0.150	−0.056	0.294	0.383	0.270	0.557	0.386	0.234	0.478	0.271	0.131	0.363	0.515	0.410	0.598
M6	7	0.359	0.292	0.419	0.670	0.569	0.778	0.363	0.179	0.468	0.388	0.261	0.527	0.373	0.288	0.486
M6	8	0.135	−0.077	0.304	0.337	0.246	0.574	0.276	0.091	0.412	0.271	0.105	0.359	0.471	0.348	0.573
M6	9	0.383	0.279	0.451	0.701	0.613	0.811	0.446	0.319	0.522	0.441	0.349	0.618	0.302	0.207	0.403
M6	6789	0.278	0.129	0.388	0.624	0.522	0.761	0.404	0.234	0.492	0.395	0.259	0.525	0.431	0.363	0.532
M6	789	0.319	0.202	0.409	0.661	0.567	0.788	0.400	0.223	0.487	0.418	0.287	0.564	0.395	0.328	0.499
M6	79	0.382	0.294	0.432	0.703	0.611	0.811	0.420	0.275	0.508	0.428	0.314	0.595	0.343	0.256	0.447
M6	89	0.274	0.127	0.397	0.630	0.540	0.773	0.397	0.234	0.493	0.417	0.283	0.559	0.401	0.338	0.498
M7	1	0.040	−0.151	0.201	−0.077	−0.155	0.021	0.031	−0.046	0.151	0.019	−0.133	0.118	−0.046	−0.145	0.056
M7	2	0.040	−0.151	0.201	0.045	−0.082	0.258	0.030	−0.045	0.016	0.030	−0.101	0.169	−0.055	−0.139	0.013
M7	3	0.080	−0.021	0.239	0.040	−0.071	0.230	0.007	−0.105	0.074	−0.065	−0.144	0.018	0.085	−0.051	0.188
M7	4	0.030	−0.055	0.192	0.028	−0.060	0.128	0.021	−0.169	0.173	0.035	−0.098	0.176	0.039	−0.129	0.180
M7	5	−0.038	−0.183	0.049	0.030	−0.005	0.123	0.022	−0.160	0.165	0.105	−0.062	0.266	0.107	−0.008	0.257
M7	6	0.023	−0.128	0.175	−0.099	−0.196	−0.007	−0.054	−0.176	0.066	0.048	−0.016	0.163	0.100	−0.008	0.026
M7	7	0.105	−0.057	0.226	0.188	0.083	0.268	0.183	0.025	0.346	0.290	0.124	0.478	0.161	0.036	0.255
M7	8	0.027	−0.077	0.196	−0.058	−0.099	−0.016	0.170	0.020	0.345	0.055	−0.065	0.138	0.106	0.032	0.202
M7	9	0.108	−0.013	0.207	0.206	0.080	0.315	0.228	0.107	0.308	0.134	−0.004	0.285	−0.020	−0.151	0.084
M7	6789	0.080	−0.044	0.167	0.200	0.075	0.294	0.263	0.170	0.391	0.288	0.158	0.439	0.121	−0.018	0.239
M7	789	0.094	−0.069	0.195	0.244	0.137	0.325	0.264	0.169	0.391	0.286	0.152	0.440	0.121	−0.018	0.239
M7	79	0.132	−0.027	0.251	0.244	0.137	0.325	0.264	0.169	0.391	0.283	0.147	0.434	0.103	−0.029	0.222
M7	89	0.029	−0.114	0.115	0.206	0.080	0.315	0.228	0.107	0.308	0.140	−0.011	0.299	0.032	−0.059	0.178
M8	1	0.126	0.059	0.251	0.019	−0.121	0.099	0.255	0.114	0.351	−0.071	−0.126	−0.019	0.376	0.284	0.521
M8	2	0.126	0.059	0.251	0.074	−0.067	0.157	0.238	0.156	0.326	−0.080	−0.176	0.012	0.519	0.449	0.583
M8	3	−0.050	−0.155	0.012	0.146	0.055	0.252	0.364	0.228	0.500	−0.016	−0.118	0.059	0.511	0.434	0.588
M8	4	0.022	−0.119	0.209	0.176	0.079	0.328	0.372	0.288	0.465	0.050	−0.077	0.184	0.517	0.437	0.613
M8	5	0.056	−0.013	0.196	0.098	0.009	0.232	0.381	0.183	0.507	0.057	−0.087	0.229	0.517	0.448	0.625
M8	6	0.210	0.072	0.389	0.133	−0.045	0.206	0.434	0.357	0.531	0.053	−0.197	0.200	0.486	0.423	0.571
M8	7	0.227	0.052	0.403	0.277	−0.010	0.448	0.327	0.122	0.455	0.104	−0.049	0.205	0.216	0.124	0.321
M8	8	0.038	−0.067	0.147	0.046	−0.087	0.156	0.379	0.323	0.438	−0.071	−0.179	−0.013	0.506	0.407	0.617
M8	9	0.264	0.089	0.346	0.374	0.213	0.469	0.371	0.267	0.467	0.028	−0.118	0.287	0.147	0.039	0.246
M8	6789	0.308	0.112	0.415	0.111	−0.190	0.276	0.441	0.334	0.527	0.065	−0.193	0.200	0.428	0.353	0.529
M8	789	0.287	0.091	0.419	0.075	−0.227	0.283	0.409	0.294	0.504	0.062	−0.151	0.178	0.368	0.285	0.489
M8	79	0.286	0.089	0.419	0.066	−0.224	0.275	0.374	0.247	0.475	0.070	−0.133	0.172	0.217	0.129	0.322
M8	89	0.265	0.090	0.348	0.282	0.156	0.442	0.422	0.346	0.491	−0.095	−0.283	0.038	0.451	0.391	0.564
M9	1	0.190	0.087	0.295	0.284	0.173	0.351	0.317	0.182	0.456	0.187	0.047	0.348	0.530	0.457	0.628
M9	2	0.190	0.087	0.295	0.224	0.119	0.379	0.369	0.270	0.528	0.200	0.085	0.327	0.605	0.500	0.669
M9	3	0.271	0.176	0.416	0.395	0.279	0.562	0.471	0.370	0.661	0.374	0.219	0.475	0.618	0.493	0.705
M9	4	0.320	0.209	0.434	0.432	0.327	0.611	0.461	0.350	0.601	0.379	0.267	0.496	0.632	0.520	0.708
M9	5	0.367	0.236	0.461	0.427	0.274	0.634	0.496	0.325	0.627	0.346	0.235	0.498	0.625	0.517	0.698
M9	6	0.366	0.230	0.462	0.514	0.429	0.626	0.517	0.421	0.622	0.480	0.387	0.536	0.612	0.451	0.702
M9	7	0.433	0.277	0.539	0.691	0.616	0.776	0.537	0.452	0.599	0.453	0.335	0.591	0.548	0.467	0.607
M9	8	0.365	0.241	0.438	0.446	0.350	0.627	0.477	0.376	0.604	0.379	0.259	0.507	0.596	0.490	0.691
M9	9	0.452	0.341	0.592	0.717	0.648	0.825	0.518	0.398	0.600	0.447	0.317	0.615	0.445	0.321	0.557
M9	6789	0.436	0.314	0.542	0.665	0.592	0.763	0.557	0.448	0.666	0.451	0.357	0.544	0.599	0.500	0.671
M9	789	0.422	0.321	0.522	0.683	0.612	0.785	0.558	0.468	0.658	0.447	0.316	0.579	0.599	0.502	0.678
M9	79	0.457	0.311	0.563	0.713	0.638	0.810	0.543	0.456	0.616	0.455	0.324	0.622	0.519	0.452	0.602
M9	89	0.425	0.327	0.521	0.690	0.623	0.799	0.541	0.446	0.657	0.430	0.325	0.544	0.599	0.498	0.701

Back to article page

ISSN: 1746-4811

Contact us

Submission enquiries: journalsubmissions@springernature.com