TY - JOUR AU - Gaj, T. AU - Gersbach, C. A. AU - Barbas, C. F. PY - 2013 DA - 2013// TI - ZFN, TALEN, and CRISPR/Cas-based methods for genome engineering JO - Trends Biotechnol VL - 31 UR - https://doi.org/10.1016/j.tibtech.2013.04.004 DO - 10.1016/j.tibtech.2013.04.004 ID - Gaj2013 ER - TY - JOUR AU - Ding, D. AU - Chen, K. AU - Chen, Y. AU - Li, H. AU - Xie, K. PY - 2018 DA - 2018// TI - Engineering introns to express RNA guides for Cas9- and Cpf1-mediated multiplex genome editing JO - Mol Plant VL - 11 UR - https://doi.org/10.1016/j.molp.2018.02.005 DO - 10.1016/j.molp.2018.02.005 ID - Ding2018 ER - TY - JOUR AU - Veillet, F. AU - Chauvin, L. AU - Kermarrec, M. P. AU - Sevestre, F. AU - Merrer, M. AU - Terret, Z. AU - Szydlowski, N. AU - Devaux, P. AU - Gallois, J. L. AU - Chauvin, J. E. PY - 2019 DA - 2019// TI - The Solanum tuberosum GBSSI gene: a target for assessing gene and base editing in tetraploid potato JO - Plant Cell Rep VL - 38 UR - https://doi.org/10.1007/s00299-019-02426-w DO - 10.1007/s00299-019-02426-w ID - Veillet2019 ER - TY - JOUR AU - Li, Y. AU - Zhu, J. AU - Wu, H. AU - Liu, C. AU - Huang, C. AU - Lan, J. AU - Zhao, Y. AU - Xie, C. PY - 2020 DA - 2020// TI - Precise base editing of non-allelic acetolactate synthase genes confers sulfonylurea herbicide resistance in maize JO - Crop J VL - 8 UR - https://doi.org/10.1016/j.cj.2019.10.001 DO - 10.1016/j.cj.2019.10.001 ID - Li2020 ER - TY - JOUR AU - Okada, A. AU - Arndell, T. AU - Borisjuk, N. AU - Sharma, N. AU - Watson-Haigh, N. S. AU - Tucker, E. J. AU - Baumann, U. AU - Langridge, P. AU - Whitford, R. PY - 2019 DA - 2019// TI - CRISPR/Cas9-mediated knockout of Ms1 enables the rapid generation of male-sterile hexaploid wheat lines for use in hybrid seed production JO - Plant Biotechnol J VL - 17 UR - https://doi.org/10.1111/pbi.13106 DO - 10.1111/pbi.13106 ID - Okada2019 ER - TY - JOUR AU - Amin, N. A. AU - Ahmad, N. AU - Wu, N. AU - Pu, X. AU - Ma, T. AU - Du, Y. AU - Bo, X. AU - Wang, N. AU - Sharif, R. AU - Wang, P. PY - 2019 DA - 2019// TI - CRISPR-Cas9 mediated targeted disruption of FAD2–2 microsomal omega-6 desaturase in soybean (Glycine max.L) JO - BMC Biotechnol. VL - 19 ID - Amin2019 ER - TY - JOUR AU - Waterworth, W. M. AU - Drury, G. E. AU - Bray, C. M. AU - West, C. PY - 2011 DA - 2011// TI - Repairing breaks in the plant genome: the importance of keeping it together JO - New Phytol VL - 192 UR - https://doi.org/10.1111/j.1469-8137.2011.03926.x DO - 10.1111/j.1469-8137.2011.03926.x ID - Waterworth2011 ER - TY - JOUR AU - Zhao, C. AU - Wang, Y. AU - Nie, X. AU - Han, X. AU - Liu, H. AU - Li, G. AU - Yang, G. AU - Ruan, J. AU - Ma, Y. AU - Li, X. AU - Cheng, H. AU - Zhao, S. AU - Fang, Y. AU - Xie, S. PY - 2019 DA - 2019// TI - Evaluation of the effects of sequence length and microsatellite instability on single-guide RNA activity and specificity JO - Int J Biol Sci VL - 15 UR - https://doi.org/10.7150/ijbs.37152 DO - 10.7150/ijbs.37152 ID - Zhao2019 ER - TY - JOUR AU - Xie, S. AU - Shen, B. AU - Zhang, C. AU - Huang, X. AU - Zhang, Y. PY - 2014 DA - 2014// TI - sgRNAcas9: a software package for designing CRISPR sgRNA and evaluating potential off-target cleavage sites JO - PLoS ONE VL - 9 ID - Xie2014 ER - TY - JOUR AU - Chen, X. AU - Lu, X. AU - Shu, N. AU - Wang, S. AU - Wang, J. AU - Wang, D. AU - Guo, L. AU - Ye, W. PY - 2017 DA - 2017// TI - Targeted mutagenesis in cotton (Gossypium hirsutum L.) using the CRISPR/Cas9 system JO - Sci Rep. VL - 7 UR - https://doi.org/10.1038/srep44304 DO - 10.1038/srep44304 ID - Chen2017 ER - TY - JOUR AU - Gao, W. AU - Long, L. AU - Tian, X. AU - Xu, F. AU - Liu, J. AU - Singh, P. K. AU - Botella, J. R. AU - Song, C. PY - 2017 DA - 2017// TI - Genome editing in cotton with the CRISPR/Cas9 system JO - Front Plant Sci VL - 8 UR - https://doi.org/10.3389/fpls.2017.01364 DO - 10.3389/fpls.2017.01364 ID - Gao2017 ER - TY - JOUR AU - Hu, J. AU - Li, S. AU - Li, Z. AU - Li, H. AU - Song, W. AU - Zhao, H. AU - Lai, J. AU - Xia, L. AU - Li, D. AU - Zhang, Y. PY - 2019 DA - 2019// TI - A barley stripe mosaic virus-based guide RNA delivery system for targeted mutagenesis in wheat and maize JO - Mol Plant Pathol VL - 20 UR - https://doi.org/10.1111/mpp.12849 DO - 10.1111/mpp.12849 ID - Hu2019 ER - TY - JOUR AU - Yin, K. AU - Han, T. AU - Liu, G. AU - Chen, T. AU - Wang, Y. AU - Alice, Y. Y. AU - Liu, Y. PY - 2015 DA - 2015// TI - A geminivirus-based guide RNA delivery system for CRISPR/Cas9 mediated plant genome editing JO - Sci Rep VL - 5 ID - Yin2015 ER - TY - JOUR AU - Ali, Z. AU - Abul-faraj, A. AU - Li, L. AU - Ghosh, N. AU - Piatek, M. AU - Mahjoub, A. AU - Aouida, M. AU - Piatek, A. AU - Baltes, N. J. AU - Voytas, D. F. AU - Dinesh-Kumar, S. AU - Mahfouz, M. M. PY - 2015 DA - 2015// TI - Efficient virus-mediated genome editing in plants using the CRISPR/Cas9 system JO - Mol Plant VL - 8 UR - https://doi.org/10.1016/j.molp.2015.02.011 DO - 10.1016/j.molp.2015.02.011 ID - Ali2015 ER - TY - JOUR AU - Ali, Z. AU - Eid, A. AU - Ali, S. AU - Mahfouz, M. M. PY - 2018 DA - 2018// TI - Pea early-browning virus-mediated genome editing via the CRISPR/Cas9 system in Nicotiana benthamiana and Arabidopsis JO - Virus Res VL - 244 UR - https://doi.org/10.1016/j.virusres.2017.10.009 DO - 10.1016/j.virusres.2017.10.009 ID - Ali2018 ER - TY - JOUR AU - Cody, W. B. AU - Scholthof, H. B. AU - Mirkov, T. E. PY - 2017 DA - 2017// TI - Multiplexed gene editing and protein overexpression using a tobacco mosaic virus viral vector JO - Plant Physiol VL - 175 UR - https://doi.org/10.1104/pp.17.00411 DO - 10.1104/pp.17.00411 ID - Cody2017 ER - TY - JOUR AU - Jiang, N. AU - Zhang, C. AU - Liu, J. AU - Guo, Z. AU - Zhang, Z. AU - Han, C. AU - Wang, Y. PY - 2019 DA - 2019// TI - Development of Beet necrotic yellow vein virus-based vectors for multiple-gene expression and guide RNA delivery in plant genome editing JO - Plant Biotechnol J VL - 17 UR - https://doi.org/10.1111/pbi.13055 DO - 10.1111/pbi.13055 ID - Jiang2019 ER - TY - JOUR AU - Qu, F. AU - Ye, X. AU - Hou, G. AU - Sato, S. AU - Clemente, T. E. AU - Morris, T. J. PY - 2005 DA - 2005// TI - RDR6 has a broad-spectrum but temperature-dependent antiviral defense role in Nicotiana benthamiana JO - J Virol VL - 79 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.79.24.15209-15217.2005 DO - 10.1128/JVI.79.24.15209-15217.2005 ID - Qu2005 ER - TY - JOUR AU - Schwach, F. AU - Vaistij, F. E. AU - Jones, L. AU - Baulcombe, D. C. PY - 2005 DA - 2005// TI - An RNA-dependent RNA polymerase prevents meristem invasion by potato virus X and is required for the activity but not the production of a systemic silencing signal JO - Plant Physiol VL - 138 UR - https://doi.org/10.1104/pp.105.063537 DO - 10.1104/pp.105.063537 ID - Schwach2005 ER - TY - JOUR AU - Luo, K. AU - Huang, N. AU - Yu, T. PY - 2018 DA - 2018// TI - Selective targeting of mobile mRNAs to plasmodesmata for cell-to-cell movement JO - Plant Physiol VL - 177 UR - https://doi.org/10.1104/pp.18.00107 DO - 10.1104/pp.18.00107 ID - Luo2018 ER - TY - JOUR AU - Gu, Z. AU - Huang, C. AU - Li, F. AU - Zhou, X. PY - 2014 DA - 2014// TI - A versatile system for functional analysis of genes and microRNAs in cotton JO - Plant Biotechnol J VL - 12 UR - https://doi.org/10.1111/pbi.12169 DO - 10.1111/pbi.12169 ID - Gu2014 ER - TY - JOUR AU - Clough, S. J. AU - Bent, A. F. PY - 1998 DA - 1998// TI - Floral dip: a simplified method for Agrobacterium-mediated transformation of Arabidopsis thaliana JO - Plant J VL - 16 UR - https://doi.org/10.1046/j.1365-313x.1998.00343.x DO - 10.1046/j.1365-313x.1998.00343.x ID - Clough1998 ER - TY - JOUR AU - Murashige, T. AU - Skoog, F. PY - 1962 DA - 1962// TI - A revised medium for rapid growth and bio assays with tobacco tissue cultures JO - Physiol Plantarum VL - 15 UR - https://doi.org/10.1111/j.1399-3054.1962.tb08052.x DO - 10.1111/j.1399-3054.1962.tb08052.x ID - Murashige1962 ER - TY - JOUR AU - Feng, Z. AU - Zhang, B. AU - Ding, W. AU - Liu, X. AU - Yang, D. AU - Wei, P. AU - Cao, F. AU - Zhu, S. AU - Zhang, F. AU - Mao, Y. AU - Zhu, J. PY - 2013 DA - 2013// TI - Efficient genome editing in plant using CRISPR/Cas system JO - Cell Res VL - 23 UR - https://doi.org/10.1038/cr.2013.114 DO - 10.1038/cr.2013.114 ID - Feng2013 ER - TY - JOUR AU - Erijman, A. AU - Shifman, J. M. AU - Peleg, Y. PY - 2014 DA - 2014// TI - A single-tube assembly of DNA using the transfer-PCR (TPCR) platform JO - Methods Mol Biol VL - 1116 UR - https://doi.org/10.1007/978-1-62703-764-8_7 DO - 10.1007/978-1-62703-764-8_7 ID - Erijman2014 ER - TY - JOUR AU - Long, L. AU - Guo, D. AU - Gao, W. AU - Yang, W. AU - Hou, L. AU - Ma, X. AU - Miao, Y. AU - Botella, J. R. AU - Song, C. PY - 2018 DA - 2018// TI - Optimization of CRISPR/Cas9 genome editing in cotton by improved sgRNA expression JO - Plant Methods VL - 14 UR - https://doi.org/10.1186/s13007-018-0353-0 DO - 10.1186/s13007-018-0353-0 ID - Long2018 ER - TY - JOUR AU - Livak, K. J. AU - Schmittgen, T. D. PY - 2001 DA - 2001// TI - Analysis of relative gene expression data using Real-Time quantitative PCR and the 2-ΔΔCT method JO - Methods VL - 25 UR - https://doi.org/10.1006/meth.2001.1262 DO - 10.1006/meth.2001.1262 ID - Livak2001 ER - TY - JOUR AU - Cho, S. AU - Shin, J. AU - Cho, B. K. PY - 2018 DA - 2018// TI - Applications of CRISPR/Cas system to bacterial metabolic engineering JO - Int J Mol Sci VL - 19 UR - https://doi.org/10.3390/ijms19041089 DO - 10.3390/ijms19041089 ID - Cho2018 ER - TY - JOUR AU - Liu, X. AU - Wu, S. AU - Xu, J. AU - Sui, C. AU - Wei, J. PY - 2017 DA - 2017// TI - Application of CRISPR/Cas9 in plant biology JO - Acta Pharm Sin B VL - 7 UR - https://doi.org/10.1016/j.apsb.2017.01.002 DO - 10.1016/j.apsb.2017.01.002 ID - Liu2017 ER - TY - JOUR AU - Li, J. AU - Chory, J. PY - 1997 DA - 1997// TI - A putative leucine-rich repeat receptor kinase involved in brassinosteroid signal transduction JO - Cell VL - 90 UR - https://doi.org/10.1016/S0092-8674(00)80357-8 DO - 10.1016/S0092-8674(00)80357-8 ID - Li1997 ER - TY - JOUR AU - Rerie, W. G. AU - Feldmann, K. A. AU - Marks, M. D. PY - 1994 DA - 1994// TI - The GLABRA2 gene encodes a homeo domain protein required for normal trichome development in Arabidopsis JO - Gene Dev VL - 8 UR - https://doi.org/10.1101/gad.8.12.1388 DO - 10.1101/gad.8.12.1388 ID - Rerie1994 ER - TY - JOUR AU - Yan, L. AU - Wu, Y. AU - Li, H. AU - Yang, W. AU - Wei, S. AU - Hu, R. AU - Xie, Q. PY - 2015 DA - 2015// TI - High efficiency genome editing in Arabidopsis using Yao promoter-driven CRISPR/Cas9 system JO - Mol Plant VL - 8 UR - https://doi.org/10.1016/j.molp.2015.10.004 DO - 10.1016/j.molp.2015.10.004 ID - Yan2015 ER - TY - JOUR AU - Takada, S. AU - Goto, K. PY - 2003 DA - 2003// TI - Terminal flower 2, an Arabidopsis homology of heterochromatin protein 1, counteracts the activation of FLOWERING LOCUS T by constans in the vascular tissues of leaves to regulate flowering time JO - Plant Cell VL - 15 UR - https://doi.org/10.1105/tpc.016345 DO - 10.1105/tpc.016345 ID - Takada2003 ER - TY - JOUR AU - Abe, M. AU - Kobayashi, Y. AU - Yamamoto, S. AU - Daimon, Y. AU - Yamaguchi, A. AU - Ikeda, Y. AU - Ichinoki, H. AU - Notaguchi, M. AU - Goto, K. AU - Araki, T. PY - 2005 DA - 2005// TI - FD, a bZIP protein mediating signals from the floral pathway integrator FT at the shoot apex JO - Science VL - 309 UR - https://doi.org/10.1126/science.1115983 DO - 10.1126/science.1115983 ID - Abe2005 ER - TY - JOUR AU - An, H. L. AU - Roussot, C. AU - Suarez-Lopez, P. AU - Corbesier, L. AU - Vincent, C. AU - Pineiro, M. AU - Hepworth, S. AU - Mouradov, A. AU - Justin, S. AU - Turnbull, C. AU - Coupland, G. PY - 2004 DA - 2004// TI - CONSTANS acts in the phloem to regulate a systemic signal that induces photoperiodic flowering of Arabidopsis JO - Development VL - 131 UR - https://doi.org/10.1242/dev.01231 DO - 10.1242/dev.01231 ID - An2004 ER - TY - JOUR AU - Wigge, P. A. AU - Kim, M. C. AU - Jaeger, K. E. AU - Busch, W. AU - Schmid, M. AU - Lohmann, J. U. AU - Weigel, D. PY - 2005 DA - 2005// TI - Integration of spatial and temporal information during floral induction in Arabidopsis JO - Science VL - 309 UR - https://doi.org/10.1126/science.1114358 DO - 10.1126/science.1114358 ID - Wigge2005 ER - TY - JOUR AU - Li, C. AU - Zhang, K. AU - Zeng, X. AU - Jackson, S. AU - Zhou, Y. AU - Hong, Y. PY - 2009 DA - 2009// TI - A cis element within flowering locus T mRNA determines its mobility and facilitates trafficking of heterologous viral RNA JO - J Virol VL - 83 UR - https://doi.org/10.1128/JVI.02346-08 DO - 10.1128/JVI.02346-08 ID - Li2009 ER - TY - JOUR AU - Li, C. AU - Gu, M. AU - Shi, N. AU - Zhang, H. AU - Yang, X. AU - Osman, T. AU - Liu, Y. AU - Wang, H. AU - Vatish, M. AU - Jackson, S. AU - Hong, Y. PY - 2011 DA - 2011// TI - Mobile FT mRNA contributes to the systemic florigen signalling in floral induction JO - Sci Rep VL - 1 UR - https://doi.org/10.1038/srep00073 DO - 10.1038/srep00073 ID - Li2011 ER - TY - JOUR AU - Tuttle, J. R. AU - Haigler, C. H. AU - Robertson, D. PY - 2012 DA - 2012// TI - Method: low-cost delivery of the cotton leaf crumple virus-induced gene silencing system JO - Plant Methods VL - 8 UR - https://doi.org/10.1186/1746-4811-8-27 DO - 10.1186/1746-4811-8-27 ID - Tuttle2012 ER - TY - JOUR AU - Wu, H. AU - Qu, X. AU - Dong, Z. AU - Luo, L. AU - Shao, C. AU - Forner, J. AU - Lohmann, J. U. AU - Su, M. AU - Xu, M. AU - Liu, X. AU - Zhu, L. AU - Zeng, J. AU - Liu, S. AU - Tian, Z. AU - Zhao, Z. PY - 2020 DA - 2020// TI - WUSCHEL triggers innate antiviral immunity in plant stem cells JO - Science VL - 370 UR - https://doi.org/10.1126/science.abb7360 DO - 10.1126/science.abb7360 ID - Wu2020 ER - TY - JOUR AU - Evan, E. E. AU - Ugrappa, N. AU - Maria, E. G. AU - Pin-jui, H. AU - Savithramma, D. K. AU - Daniel, F. V. PY - 2020 DA - 2020// TI - Multiplexed heritable gene editing using RNA viruses and mobile single guide RNAs JO - Nat Plant VL - 6 UR - https://doi.org/10.1038/s41477-020-0670-y DO - 10.1038/s41477-020-0670-y ID - Evan2020 ER - TY - JOUR AU - Corbesier, L. AU - Vincent, C. AU - Jang, S. AU - Fornara, F. AU - Fan, Q. AU - Searle, I. AU - Giakountis, A. AU - Farrona, S. AU - Gissot, L. AU - Turnbull, C. AU - Coupland, G. PY - 2007 DA - 2007// TI - FT protein movement contributes to long-distance signaling in floral induction of Arabidopsis JO - Science VL - 316 UR - https://doi.org/10.1126/science.1141752 DO - 10.1126/science.1141752 ID - Corbesier2007 ER - TY - JOUR AU - Tamaki, S. AU - Matsuo, S. AU - Wong, H. AU - Yokoi, S. AU - Shimamoto, K. PY - 2007 DA - 2007// TI - Hd3a protein is a mobile flowering signal in rice JO - Science VL - 316 UR - https://doi.org/10.1126/science.1141753 DO - 10.1126/science.1141753 ID - Tamaki2007 ER -